Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Scn4aQ9ER60 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4aQ9ER60 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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