Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms