Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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