Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms