Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ptp4a3Q9D658 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptp4a3Q9D658 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms