Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syf2Q9D198 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms