Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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