Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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