Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ddx28Q9CWT6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ddx28Q9CWT6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddx28Q9CWT6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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