Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Pfdn1Q9CWM4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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