Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms