Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms