Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms