Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Krt88Q9CPR6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Krt88Q9CPR6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Krt88Q9CPR6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Krt88Q9CPR6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Krt88Q9CPR6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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