Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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