Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms