Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TrabdQ99JY4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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