Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms