Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms