Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top1mtQ8R4U6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top1mtQ8R4U6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms