Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms