Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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