Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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