Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef8Q8CE24 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef8Q8CE24 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms