Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bcas3Q8CCN5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms