Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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