Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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