Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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