Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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FarsaQ8C0C7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FarsaQ8C0C7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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