Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cep57-203ENSMUST00000124883 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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