Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms