Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NanogQ80Z64 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms