Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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