Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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