Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa17Q64016 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa17Q64016 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms