Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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