Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms