Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms