Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tdrd5Q5VCS6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms