Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam71bQ5STT6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms