Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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