Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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