Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hvcn1Q3U2S8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hvcn1Q3U2S8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms