Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.5 ms