Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Jmjd8Q3TA59 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Jmjd8Q3TA59 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Jmjd8Q3TA59 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Jmjd8Q3TA59 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms