Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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