Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms