Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ttc21bQ0HA38 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ttc21bQ0HA38 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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