Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CbfbQ08024 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms