Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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